1. インストール

$ sudo apt-get install sdlmame

2. 設定ファイル作成

$ mame -createconfig

3. サウンドノイズ・画面ボケ対策

$ vi ~/.mame/mame.ini
samplerate 33075 ←変更
filter 0 ←変更

すまん。手抜きです。っていうか風邪ひいて休んでるんだよね。orz
上記設定以外は特にいじらず、USB接続のジョイパッドで普通に動作してます。